Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL28Q13084 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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