Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF1Q13077 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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TRAF1Q13077 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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TRAF1Q13077 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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TRAF1Q13077 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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TRAF1Q13077 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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TRAF1Q13077 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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TRAF1Q13077 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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TRAF1Q13077 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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TRAF1Q13077 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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TRAF1Q13077 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF1Q13077 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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