Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSTF3Q12996 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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