Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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TRAF2Q12933 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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TRAF2Q12933 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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TRAF2Q12933 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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TRAF2Q12933 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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TRAF2Q12933 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF2Q12933 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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TRAF2Q12933 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF2Q12933 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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