Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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