Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFCP2Q12800 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms