Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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