Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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