Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms