Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms