Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms