Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms