Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms