Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms