Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC008543.2-201ENST00000436907 1383 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 IFNA13-202ENST00000610660 1539 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 DSCR10-201ENST00000432141 860 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms