Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDR2Q01850 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms