Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
OTUD4Q01804 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
OTUD4Q01804 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
OTUD4Q01804 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
OTUD4Q01804 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
OTUD4Q01804 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
OTUD4Q01804 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
OTUD4Q01804 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
OTUD4Q01804 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
OTUD4Q01804 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
OTUD4Q01804 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
OTUD4Q01804 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
OTUD4Q01804 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
OTUD4Q01804 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms