Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms