Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms