Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF3P57682 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms