Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms