Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL23P55773 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL23P55773 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL23P55773 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL23P55773 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL23P55773 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL23P55773 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL23P55773 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL23P55773 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL23P55773 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL23P55773 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL23P55773 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL23P55773 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL23P55773 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL23P55773 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL23P55773 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL23P55773 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL23P55773 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL23P55773 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL23P55773 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL23P55773 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL23P55773 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL23P55773 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL23P55773 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL23P55773 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL23P55773 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL23P55773 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL23P55773 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL23P55773 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL23P55773 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL23P55773 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL23P55773 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms