Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCL1P53675 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCL1P53675 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCL1P53675 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCL1P53675 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCL1P53675 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCL1P53675 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCL1P53675 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCL1P53675 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCL1P53675 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLTCL1P53675 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CLTCL1P53675 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLTCL1P53675 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLTCL1P53675 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLTCL1P53675 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTCL1P53675 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms