Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms