Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms