Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT6CP48668 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms