Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RANGAP1P46060 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms