Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AFMP43652 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AFMP43652 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AFMP43652 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
AFMP43652 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AFMP43652 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AFMP43652 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AFMP43652 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AFMP43652 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AFMP43652 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
AFMP43652 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
AFMP43652 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
AFMP43652 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AFMP43652 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AFMP43652 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AFMP43652 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AFMP43652 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AFMP43652 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AFMP43652 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AFMP43652 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AFMP43652 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AFMP43652 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AFMP43652 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AFMP43652 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms