Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTGER2P43116 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms