Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM5CP41229 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5CP41229 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms