Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARGP37231 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms