Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP62P37198 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP62P37198 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP62P37198 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP62P37198 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP62P37198 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP62P37198 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP62P37198 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms