Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD12P35452 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms