Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBP1P32455 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP1P32455 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GBP1P32455 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GBP1P32455 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GBP1P32455 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GBP1P32455 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GBP1P32455 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GBP1P32455 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP1P32455 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms