Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA10P31260 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms