Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC27P30260 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC27P30260 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC27P30260 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC27P30260 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC27P30260 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC27P30260 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC27P30260 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC27P30260 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC27P30260 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC27P30260 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC27P30260 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC27P30260 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC27P30260 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC27P30260 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC27P30260 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC27P30260 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC27P30260 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms