Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHATP28329 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHATP28329 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHATP28329 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHATP28329 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHATP28329 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHATP28329 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHATP28329 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHATP28329 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHATP28329 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHATP28329 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHATP28329 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHATP28329 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHATP28329 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHATP28329 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHATP28329 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHATP28329 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHATP28329 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHATP28329 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHATP28329 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CHATP28329 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHATP28329 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHATP28329 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHATP28329 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHATP28329 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms