Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms