Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMLP26374 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMLP26374 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMLP26374 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMLP26374 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms