Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms