Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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