Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF3P18847 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF3P18847 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATF3P18847 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATF3P18847 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATF3P18847 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATF3P18847 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATF3P18847 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF3P18847 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms