Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPI1P17947 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPI1P17947 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPI1P17947 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPI1P17947 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPI1P17947 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPI1P17947 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms