Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms