Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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