Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms