Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms