Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOA1P02647 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOA1P02647 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOA1P02647 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms