Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-HP01893 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms