Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD4O95243 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD4O95243 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD4O95243 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms